Суперагент ЦРУ Джейсон Борн знову виявляється підставленим і змушений крім покладеного на нього завдання державного значення рятувати себе, а заодно й інших небайдужих йому людей. західній людині сюрпризів.

Команда італійського рибальського судна знаходить у водах Середземного моря тіло чоловіка. У нього два кульові поранення у спині та імплантований у стегно мікрофільм, позначений номером швейцарського банку. Коли незнайомець приходить до тями, виявляється, що він не пам'ятає, хто він і що з ним трапилося, однак він може говорити кількома мовами і володіє іншими незвичайними здібностями. - Джейсон

Молодий вчений випробовує на мавпах нові ліки від хвороби Альцгеймера. У препарату виявляється дивовижний побічний ефект: він підвищує кілька разів інтелект приматів.

Мутанти продовжують боротьбу проти суспільства, яке лякає їх і якому вони не довіряють. Їх становище стає ще відчайдушнішим, коли вони піддаються потужній атаці невідомого супротивника, що володіє екстраординарними здібностями. Раптовий напад знову стає причиною політичного та суспільного резонансу з приводу запровадження повсюдної реєстрації мутантів та причиною утворення руху проти мутантів,