За підтримки недобитків Клана Фут та професора Стокмана Шреддер готує план втечі, який планує здійснити під час транспортування до іншої в'язниці. Ейпріл вдається видобути інформацію про втечу з файлів професора, але черепашки-ніндзя, що подоспели на оновленому фургоні-сміттєвозі, не змогли зупинити мутованого Шреддера, який в останній момент улизнув у них з-під носа за допомогою порталу,

Старшокласник Шон Босуелл тільки і робить, що потрапляє в неприємності. Після чергової витівки - імпровізованих перегонів і аварії - хлопцеві вже світить в'язниця, тоді мати вирішує відправити його до батька в Японію. У перший же день в японській школі він знайомиться із співвітчизником, а той притягує нового друга на підпільні змагання з дріфт-рейсингу. Тут Шону відкривається досі небачене

Новий глава пригод Росомахи розгорнеться в Японії, де Логану належить з'ясувати, що гостріше - пазурі Росомахи або меч Срібного Самурая.