Ця історія розповідає про чотирьох черепашок-мутантів, які стали ізгоями через вплив радіоактивного слизу. Вони приречені на загибель, але, на щастя, їх знайшов щурів-мутант на ім'я Сплінтер, який забрав малюків до себе і виховав їх як рідних синів. Сплінтер навчив черепашок мистецтву ніндзя, перетворивши їх на безстрашних воїнів, здатних захистити своє місто від зла. Протягом багатьох років

Черепашки-ніндзя переживають найнеймовірнішу пригоду у своєму житті, випадково опинившись у Юрському Періоді. Навички ніндзя і звичка ніколи не сумувати допоможуть їм подолати всі труднощі і повернутися додому.